在防疫科学领域,伍连德率先提出“肺鼠疫”学说、确认野生啮齿类动物为疫菌宿主、发现鼠疫菌传播方式、并对鼠疫自然疫源地提出精辟的见解等,丰富和发展了防疫科学理论,对我国近现代流行病学,海港检疫理论、方法等都做出了开创性贡献。